其次便是对清帝国。

    策妄阿拉布坦与噶尔丹不同，他没有从小受到浓厚的宗教熏染，对他来说，利用宗教成就霸业，比因为宗教的虔诚而发动圣战重要的多。如果说噶尔丹是为了建立一个以黄教为国教的大帝国而奋斗终身的话，策妄阿拉布坦便是希望让黄教帮助自己成为强大帝国的统治者。

    可他没有噶尔丹那样在黄教教廷无以伦比的威望和丰富人脉，噶尔丹那种与教廷鱼水交融，共同进退的关系对策妄阿拉布坦来说完全不可想象。何况，几乎在噶尔丹走向败亡的同时，他的同窗好友，和硕特汗国第巴桑杰嘉措隐匿五世达赖圆寂的秘密被戳穿，引起教廷动荡。到和硕特汗国第四任汗王拉藏汗继位后，对于教廷的控制逐渐加强。1705年，更是杀死桑杰嘉措，废黜其拥立的六世达赖仓央嘉措，从新选定阿旺伊西嘉措为六世达赖。原本独立的教权如今已经完全掌握在和硕特汗廷手中。

    当务之急，控制教廷，号令蒙古各部，是针对清朝最好的策略。这要比直接与清朝进行单挑有利得多。而局势也有可利用的变化：青海诸和硕特台吉不满拉藏汗擅自废黜达赖喇嘛，把在青海找到的格桑嘉措宣布为六世达赖喇嘛，与拉藏汗对立。

    策略应当如此，时局可以如此，虽然自己的妻子之一是拉藏汗的妹妹，自己的女儿又嫁给拉藏汗长子，策妄阿拉布坦也只能拿自己的大舅哥兼亲家公开刀了。

    1716年底，经过缜密策划，策妄阿拉布坦命大策零顿多布率军6000以护送拉藏汗长子噶登丹衷及其妻子回藏的名义向西藏进军，同时另派300人的队伍前往青海塔尔寺，准备劫持被青海诸台吉拥立的格桑嘉措一起前往西藏。

    这本是大有可为的计划，但策妄阿拉布坦却太过忽略了清军的警惕性，格桑嘉措在清军的监护下哪里是300人便可以劫持得了？结果，当大策零顿多布率领铁骑飞渡万里关山，到达西藏那木错湖的时候，与他同时出发的小分队却被清军击溃。

    准噶尔最后未能控制西藏，这是至关重要的一步。

    拉藏汗虽然接到麾下将领的警报，但对于准噶尔军会袭击自己根本未做准备，结果，大策零顿多布一路上宣传自己是拥立格桑嘉措回藏，获取了西藏人心，沿途关隘无不望风而降。

    已失先机的拉藏汗想在当雄草原迎战准噶尔军，但又接受了属下错误的建议，全军回师拉萨固守待援，完全放弃了战略主动。

    1717年11月，准噶尔军兵临城下，将拉萨城围得水泄不通。拉藏汗众叛亲离，各大寺的喇嘛以及下属官员纷纷投降准噶尔军。月底，大策零顿多布指挥全军攻城，不费吹灰之力便攻陷拉萨。拉藏汗战死，长子被杀，次子被俘，和硕特汗国覆亡。

    可在战场上指挥若定的大策零顿多布却是个政治上低能儿，进入拉萨后，纵兵抢掠，甚至连布达拉宫都进行洗劫。原本人心所向的局面，顿时成为人心离散。

    再加上劫持格桑嘉措的计划失败，“护送格桑嘉措回藏”也成了谎言，藏人对于准噶尔更是深恶痛绝。

    黄教是清廷赖以安定众蒙古的重要保障，黄教圣地被准噶尔控制无论如何是不能容忍的，康熙皇帝迅速做出了反应。

    1718年3月，西安将军额伦特率军7000与四川提督康泰所率1000偏师分别从青海的库库赛、拜图和四川打箭炉进入西藏，欲图驱逐准噶尔军。

    大策零顿多布再次发挥了他的军事天才，先派轻骑引诱青海一路清军主力，后又派人诈降，带着清军一步步进入自己精心布置的包围圈。额伦特为了速战速决，沿途之上不设兵站，一路急行军，使得人困马乏，后援也完全无法保障。

    7月17日，额伦特所部6000余人到达那曲，才发现上当，但大策零顿多