故事并无提及年份，只有月份与日期，予以注明。

    故事初始约十几年前

    威廉·奥维尔在俄罗斯西部支援了被俄罗斯成教部队追杀的魔法结社“占星施术旅团”并一人击溃了俄罗斯成教的精锐部队。

    同一段时期也在法国中部阻止并歼灭了将无辜少女作为“贞德神谕”试验品的法国最大魔法结社奥尔良骑士团。

    故事初始约十年前

    威廉·奥维尔在多佛尔海峡法国侧解救了被西班牙星教派袭击的英国三公主薇莉安。此后，拒绝了成为“骑士”的邀请离开了英国，为了从外部保护英国而加入了“神之右席”，后以“后方之水”称呼。

    英国清教所属十三骑士团之一的先枪骑士团（1stncer）前往日本的一个小山村内找到了站在灰烬之海中的少女:姬神秋沙。

    故事初始几年前（御坂美琴童年时代）

    童年的御坂美琴出于好心将自己的“dna样本”提供给了不知名的研究所，引发“量产型能力者计划”启动。

    故事初始几年前（食蜂操祈少年时代）

    “量产型能力者计划”第一个实验体“妹妹”0号（多莉）诞生，由于出生时的缺陷，“妹妹”0号身体中不得不植入特殊的机械来维持自己的生命。

    在研究员的安排下，同在一间研究所的食蜂操祈与孤独的多莉成为朋友，熟悉后的多莉亲昵的称呼食蜂为“小咪”。（很可能是食蜂利用心理掌握的能力将自己伪装成多莉过去的友人，不过多莉似乎早已发现了这个谎言）

    与食蜂一同玩耍的多莉因克隆人的寿命到达临界点而开始倒下，昏迷前的多莉希望食蜂操祈能够告知她的真名，看到唯一好友被带走的食蜂消沉下来，不知何时，前来的女研究员告知她多莉已经死亡的消息。

    依靠自身能力独自调查的食蜂从研究员团体“才人工房”口中得知了“exteri一r实验计划”的完成需要依靠食蜂以及多莉，而且该实验完成时自己也会被无情的处理掉。

    为了自己目的的食蜂开始反击，将“exteri一r实验计划”有关联的人全部洗脑并置于自己的暗中支配下（而且无论用何种手段被洗脑者也不会说出有关于实验的任何情报），做好以上计划的食蜂操祈进入常盘台学院就读。

    故事初始约三年前（目录动画剧场版《恩底弥翁的奇迹》）

    已经活了1000年的不死者魔女雷蒂丽·唐格罗德为了获得死亡的解脱在学院都市企业“星轨之门社（一rbitp一rtal）”开发的试验性航天客机“猎户座号”上动手脚，实验自己能不能自杀成功，引发航天飞机降落时的坠机事故。

    坠机事故发生时机长代达罗斯·赛昆齐亚之女莎特奥拉·赛昆齐亚以自己的“愿望”创造出了一个“愿望”的集合体女孩鸣护·艾丽莎，艾丽莎歌唱所引发的“奇迹”让机上的88名乘客与机组成员全都安然无恙，但其代价是莎特奥拉失去了自己的父亲以及音感，事故后为了纪念此次“奇迹”而被称为“88人的奇迹”。（莎特奥拉之父的死亡因为报道的错误的而被抹去了记录）

    引发“猎户座号事件”的雷蒂丽·唐格罗德虽然觉得自己的实验失败，但却对诞生的非人类鸣护·艾丽莎产生浓厚的兴趣，之后将濒临破产的“星轨之门社（一rbitp一rtal）”收购，开始建造世界第一座宇宙电梯“恩底弥翁”，希望借此发动可以让整个北半球毁灭的魔法阵，借此实验自己能不能死去，而其魔法的核心则准备利用鸣护·艾丽莎来担任。

    故事初始约一年前秋季至冬季

    超能力者（lv5）中排名第一位的一方通行受邀参加了“绝对能力实验计划”，在研究所的初次实验中将妹妹（1号）杀害。