该所改为四川陆军速成学堂,学成后,被分到成都新军十七镇当排长。因他对士兵训练认真,在该部组织的会cāo、考核及比赛中,他的排多次夺魁,故1910年被晋升为四川陆军三十三混成协第一营右队队官。是年他秘密加入了孙中山领导的同盟会。1913年夏,杨森在王陵基部队任营长。这时,孙中山领导发动了第二次讨袁战争,驻防重庆之四川陆军第五师师长熊克武率部响应。王陵基团奉袁世凯之命讨伐熊克武。杨森考虑自己是同盟会员,便私下跑到熊克武部参加倒袁。可是开战不久,重庆为袁世凯所派滇军师长叶荃部、混成旅长兼前卫司令黄毓成部攻破,杨森被俘。黄毓成在集合俘虏时,见众俘虏都甚为惶恐,惟独杨森显得毫无惧色,有胆有识,又见他身材魁伟健壮,声若洪钟,便对他产生好感,留他在司令部当副官。1915年1月,黄又将他推荐到云南讲武堂任队长。这期间,他与许多滇军军官jiāo上朋友,逐步活跃起来。
同年12月,杨森由黄毓成推荐到护国军第一军第二梯队赵又新部任中校参谋,随部队进至川南,与袁世凯驻川部队作战。他两次带领部队在纳溪和泸州附近牛背石,将袁军张敬尧师之吴新田、金汉鼎部打得大败而逃。袁世凯垮台后,北洋政府任命熊克武为四川督军,统领四川境内各军。驻泸州滇军赵又新的第八师被改编为靖国军第二军,赵任军长,杨森任参谋长。
不久,川系与滇系两军为各自利益产生矛盾,继而发展为互相火拼。杨森初始参予滇军一边对川军作战。他所在滇军驻守泸州时,川军刘存厚率部攻打泸州,赵军因杨如轩团丢失外围阵地,被迫放弃泸州,杨如轩为推脱责任,借杨森原为川军,因战败被俘而参加滇军之事,诬告他通敌,铸成滇军失败。但赵又新与杨森私jiāo甚笃,未轻信杨如轩之诬告,还将新编的一个混成团jiāo给他指挥。后来,赵率部反击川军,重占泸州,川军赖心辉又乘其立足未稳,领兵三千偷袭泸州,正当滇军将要兵败城破之际,杨森率部赶到,向川军侧后发动猛烈攻击,将其击溃,泸州转危为安。赵又新对杨森此举赞赏不已,更加器重,杨森因此而在滇军中以能战之将扬名。
随着战事的进行,川滇军的矛盾越来越大,唐继尧决定对四川督军熊克武全面开战。杨森受赵又新之命去合川策动川军第二师师长刘湘联合倒熊。他向刘表白,自己身为四川军人,前因被俘,迫不得已而在滇军中谋事,但身在曹营心在汉,决不会做对不起川军的事。当他再次去策反时,即与刘湘私下商定,暗中联合对付唐继尧。川、滇军战事bào发后,刘湘则虚称支持滇军作战,并伪请赵又新派兵增援。赵即派杨森独立团前往助战。他摆脱滇军控制后,便转投川军,被熊克武任命为川军第九混成旅旅长,后又提升为第九师师长。
同年8月,川滇两军大战于龙泉山。杨森首当其冲,带领全师攻打滇军,虽然身上三处负伤,仍指挥部队猛攻。滇军大败而逃,他穷追不舍,连续七十二个小时,追击五百多华里。接着,他率部奔袭泸州,将赵又新军击败。赵仓皇逃跑被击伤。杨森赶到,令人将赵抬回城内,赵旋即毙命。杨森深感内疚,亲备棺椁收殓,并出资由赵之侄运灵枢回云南安葬。此役之后,杨森便在川军中崭露头角。
二、争霸四川有得失杨森占领成都后,便以第二军军长名义兼摄民政,cāo纵军政大权,成为直系军阀吴佩孚控制四川的代理人之一杨森在川军中站稳脚跟后,为了独占四川,便投靠吴佩孚,依靠北洋军阀势力,与川军各部角逐六年之久。
1921年,北洋军阀吴佩孚以武力控制湖北后,两广及湖南等西南、华南各省纷纷举兵讨伐吴佩孚。四川督军熊克武企图乘机向外发展,决计出兵援鄂,任命刘湘为川军总司令兼援鄂军总司令,同时任第二军军长。杨森