海久事公司c上海申能集团有限公司c上海国际信托投资公司c上海华生化工有限公司c上海新公司等七家上海大型国有企业共同参股组建新的上海申花股份有限公司原申花集团一分未占实际上已退出了新集团的决策层只不过新组建的公司保留了“申花”的名称据说是股东们认为这一名称拥有巨大的无形资产新的上海申花股份公司董事长由董事会选举上海市黄浦区人大常委会副主任陈希安担任巴士公司老总王力群任副董事长郁知非被董事会任命为新申花的总经理

    2001年12月19日由上海广电（集团）有限公司上海文化广播影视集团上海市黄浦区国有资产总公司三家单位对原上海申花足球俱乐部有限公司进行重组成立上海申花sva文广足球俱乐部有限公司重组后的新公司定名为上海申花sva文广足球俱乐部有限公司俱乐部定名为上海申花sva文广足球俱乐部球队则称上海申花sva队俱乐部成立后申花重新聘请徐根宝出任主帅并补充了杜威c孙祥等年轻球员但是球队原有的核心申思c祁宏c吴承瑛却也先后转会到新出现的同城对手上海中远队上海足坛形成了两强争霸的局面队员们一直按照“一流城市要有一流球队要有一往无前的精神压倒一切的气势”的要求以旺盛的斗志和兢兢业业的敬业精神取得优秀的成绩

    2003年俱乐部加大投入引进了前德国国脚阿尔贝茨前皇马球员佩特科维奇等著名球星杜威c于涛c孙吉c孙祥等年轻球员也渐渐成长起來成为球队的主心骨在主教练吴金贵的带领下夺取了当年甲a联赛的冠军

    2004年是球队动荡的一年年初因为原球队主教练吴金贵出任国家队助理教练球队在年初a3联赛和亚冠联赛中的成绩差强人意3月俱乐部聘请了英国籍教头威尔金森出任球队技术总监并履行主教练一职签订了3月+7月的工作合同在威尔金森的带领下队中像李大维c王珂等小将在一系列比赛中表现出色但是5月中旬首届中超联赛开幕前威尔金森在履行完3个月的工作合同后离开申花助理教练贾秀全出任球队代理主教练但是联赛中的成绩不能让人满意贾秀全在10月告别申花俱乐部又找來的俄罗斯教练涅波出任主教练原主教练吴金贵也回到申花出任俱乐部副总经理但是为时已晚球队当年联赛成绩位列倒数第三

    2005在主教练涅波的带领下球队取得了中超联赛亚军的成绩

    2006年吴金贵又重新回到主教练的岗位上塞黑联赛最佳中场尤万c前拜仁空霸扬克尔相继加盟申花但是球队还是功亏一篑仍然与联赛冠军失之交臂

    2007年初上海滩足球资源重组上海申花与上海联城合并组成新申花乌拉圭教头吉梅内斯取代吴金贵出任球队主教练当年球队力压韩日球队为中国首次夺得a3联赛的冠军联赛中因为成绩不佳吉梅内斯中途下课吴金贵出任代理主教练一职带领球队取得了第4的成绩年末在申花俱乐部成立14周年的大会上投资人朱骏宣布吴金贵为2008赛季申花队的主教练

    2008年在上海菲亚特三角赛中（0：1负帕尔马2：1胜尤文图斯）获得亚军9月球队在联赛形势危急的情况下宣布主教练吴金贵“下课”贾秀全出任球队执行教练最终球队取得了中超联赛亚军的成绩

    2009年贾秀全留任主教练联赛最后一轮上海申花以2：1战胜长沙金德由于积分和山东鲁能c天津泰达相同而算三队之间比赛的小分后积分少于山东鲁能只拿到中超第五名

    2009年12月上海申花足球俱乐部以100万欧元的年薪签下克罗地亚名帅米洛斯拉夫·布拉泽维奇先生布拉泽维奇先生将率领申花俱乐部征战2010年的中超联赛

    2010年5月26日上海申花1：0战胜深圳红钻成为中国职业联赛继大连实德后第二支200场胜利的俱乐部

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